Оставаясь под шведским господством, Финляндия двенадцать раз была ареной войн между Швецией и Россией. Ее восточные границы переносились семь раз. В царствование Ивана Грозного финская земля была также полем битвы между русскими и шведами за господство над Эстонией,
Хотя финны составляли только треть населения королевства, из них порой набиралась почти половина шведской армии. Основная часть кавалерии, которую шведский король послал сражаться в Европу во время Тридцатилетней войны, состояла из финнов — знаменитых хаккапелитов (от военного клича "хакка пяялле", означающего "бей сверху"), наводивших ужас на римскую католическую церковь. Эта война прославила финских воинов, однако в то время как они побеждали в долгих боях под Лютценом, изнуренные долгими годами нищеты, порожденной затянувшейся войной, крестьянское население страны умирало от голода,
В начале XVII в., когда Швеция завоевала Приладожскую Карелию, была сделана попытка обратить православных местных жителей в лютеранство. Это привело к тому, что большая часть карелов переселилась в Россию. Дома в покинутых деревнях заняли протестанты, которые притесняли малочисленное православное население.
В эти десятилетия шведское влияние еще более усилилось. При короле Карле XII Финляндия была фактически превращена в объединение рядовых губерний. Северная война (1700-1721), известная в истории страны как "великое лихолетье", оказала разрушающее влияние и на положение крестьянства и на экономику в целом.
После смерти Карла XII в 1721 г. Швеция была вынуждена подписать Ништадский мир, по которому она лишалась Ингрии и части Карелии. Постепенно Финляндия стала "бедной родственницей" в шведском королевстве. Стокгольм мало интересовался своей восточной провинцией, если не были затронуты его собственные интересы.
